About ACDC Dataset

[distancezsx]

你好，请问一下ACDC数据集的预处理是需要像Synapse一样裁剪后约束在[-125,275]内，还是像你的预处理方法一样image/255呢？

[xiaol827]

我是按照trans-unet的预处理方式(./255)写的哈～

[distancezsx]

请问你这样处理论文的结果能复现吗？Transunet对数据集的预处理好像只提到对Synapse数据集进行裁剪后约束，似乎是没有提到（image/255）的处理方式哎。

[xiaol827]

结果差不多哈～（低一个百分点左右，基本都是这样）。奇怪，我刚去看了一下，似乎真没说。我记得之前是看到的。不过建议你check一下图像的值域是不是在0-255。

[distancezsx]

值域好像并不是在0-255，那么这种数据集的处理方式对训练网络是存在影响的吧。另外，想问一下你选用的哪些病例作为测试集的？打扰啦，感谢你的积极回复。

[xiaol827]

@distancezsx , 我是随机选择的，谢谢你的纠正～，code has been update，check here

[Yss83]

结果差不多哈～（低一个百分点左右，基本都是这样）。奇怪，我刚去看了一下，似乎真没说。我记得之前是看到的。不过建议你check一下图像的值域是不是在0-255。

您好，可不可以把您预处理的数据发我一份，我用了您的预处理的代码，结果dice只有0.67

[Yss83]

值域好像并不是在0-255，那么这种数据集的处理方式对训练网络是存在影响的吧。另外，想问一下你选用的哪些病例作为测试集的？打扰啦，感谢你的积极回复。

您好，可不可以把您预处理的数据发我一份，我用了您的预处理的代码，结果dice只有0.67，我的邮箱是2092269089@qq.com

[xiaol827]

值域好像并不是在0-255，那么这种数据集的处理方式对训练网络是存在影响的吧。另外，想问一下你选用的哪些病例作为测试集的？打扰啦，感谢你的积极回复。

您好，可不可以把您预处理的数据发我一份，我用了您的预处理的代码，结果dice只有0.67，我的邮箱是2092269089@qq.com

Hello, 任何数据都不允许私下分享的哈。我的话就是用现在这份代码进行的处理，然后train：test=8:2。结果都还能接受，比原论文略低

[Yss83]

您好，我是用以下病例做测试集，测试代码和原来的保持一致（acdc预处理的代码我也附上了），感谢

…

------------------ 原始邮件 ------------------ 发件人: "XL-H/ACDC_preprocess" ***@***.***>; 发送时间: 2023年2月19日(星期天) 下午4:47 ***@***.***>; ***@***.******@***.***>; 主题: Re: [XL-H/ACDC_preprocess] About ACDC Dataset (Issue #2) 值域好像并不是在0-255，那么这种数据集的处理方式对训练网络是存在影响的吧。另外，想问一下你选用的哪些病例作为测试集的？打扰啦，感谢你的积极回复。 ***@***.*** Hello, 任何数据都不允许私下分享的哈。我的话就是用现在这份代码进行的处理，然后train：test=8:2。结果都还能接受，比原论文略低 — Reply to this email directly, view it on GitHub, or unsubscribe. You are receiving this because you commented.Message ID: ***@***.***>

[Yss83]

acdc预处理的代码我是修改了您的预处理代码（您的预处理的代码在生成测试用的h5文件时，只能生成一个 ） test_h5_file.write(f'{patient}.npy.h5'+'\n') #在存储为h5文件时，会出现生成的h5文件会覆盖原来的h5文件 ------------------ 原始邮件 ------------------ 发件人: "XL-H/ACDC_preprocess" ***@***.***>; 发送时间: 2023年2月19日(星期天) 下午4:47 ***@***.***>; ***@***.******@***.***>; 主题: Re: [XL-H/ACDC_preprocess] About ACDC Dataset (Issue #2) 值域好像并不是在0-255，那么这种数据集的处理方式对训练网络是存在影响的吧。另外，想问一下你选用的哪些病例作为测试集的？打扰啦，感谢你的积极回复。 ***@***.*** Hello, 任何数据都不允许私下分享的哈。我的话就是用现在这份代码进行的处理，然后train：test=8:2。结果都还能接受，比原论文略低 — Reply to this email directly, view it on GitHub, or unsubscribe. You are receiving this because you commented.Message ID: ***@***.***>

[xiaol827]

acdc预处理的代码我是修改了您的预处理代码（您的预处理的代码在生成测试用的h5文件时，只能生成一个 ） test_h5_file.write(f'{patient}.npy.h5'+'\n') #在存储为h5文件时，会出现生成的h5文件会覆盖原来的h5文件 ------------------ 原始邮件 ------------------ 发件人: "XL-H/ACDC_preprocess" @.>; 发送时间: 2023年2月19日(星期天) 下午4:47 @.>; @.@.>; 主题: Re: [XL-H/ACDC_preprocess] About ACDC Dataset (Issue #2) 值域好像并不是在0-255，那么这种数据集的处理方式对训练网络是存在影响的吧。另外，想问一下你选用的哪些病例作为测试集的？打扰啦，感谢你的积极回复。 @.*** Hello, 任何数据都不允许私下分享的哈。我的话就是用现在这份代码进行的处理，然后train：test=8:2。结果都还能接受，比原论文略低 — Reply to this email directly, view it on GitHub, or unsubscribe. You are receiving this because you commented.Message ID: @.***>

我是用的(x-x.min())/(x.max()-x.min())对数据归一化，所以值域范围也影响不大吧。测试集set随便random了20个。然后code再进行了一次更新，是我最近一次使用的。

[Yss83]

请问，您是用哪些病人做测试用例？

…

------------------ 原始邮件 ------------------ 发件人: "XL-H/ACDC_preprocess" ***@***.***>; 发送时间: 2023年2月19日(星期天) 晚上8:02 ***@***.***>; ***@***.******@***.***>; 主题: Re: [XL-H/ACDC_preprocess] About ACDC Dataset (Issue #2) acdc预处理的代码我是修改了您的预处理代码（您的预处理的代码在生成测试用的h5文件时，只能生成一个 ） test_h5_file.write(f'{patient}.npy.h5'+'\n') #在存储为h5文件时，会出现生成的h5文件会覆盖原来的h5文件 ------------------ 原始邮件 ------------------ 发件人: "XL-H/ACDC_preprocess" @.>; 发送时间: 2023年2月19日(星期天) 下午4:47 @.>; @.@.>; 主题: Re: [XL-H/ACDC_preprocess] About ACDC Dataset (Issue #2) 值域好像并不是在0-255，那么这种数据集的处理方式对训练网络是存在影响的吧。另外，想问一下你选用的哪些病例作为测试集的？打扰啦，感谢你的积极回复。 @.*** Hello, 任何数据都不允许私下分享的哈。我的话就是用现在这份代码进行的处理，然后train：test=8:2。结果都还能接受，比原论文略低 — Reply to this email directly, view it on GitHub, or unsubscribe. You are receiving this because you commented.Message ID: @.***> 我是用的(x-x.min())/(x.max()-x.min())对数据归一化，所以值域范围也影响不大吧。测试集set随便random了20个。然后code再进行了一次更新，是我最近一次使用的。 — Reply to this email directly, view it on GitHub, or unsubscribe. You are receiving this because you commented.Message ID: ***@***.***>